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补体是机体重要的免疫效应系统之一。补体系统活化可以溶解细胞，在活化过程中产生的中间复合物及某些片段也具有多种多样的生物活性；所以补体系统结机体的作用是多方面的，既可参与机体的防御效应和自身稳定，亦可引起免疫损伤。
（一）溶细胞作用
不论何种途径活化，补体系统都能对其粘附的细胞产生溶解作用。在经典活化途径中，抗体的作用只是特异性地定位靶细胞和活化补体，而靶细胞的溶解则是补体系统的作用结果。对不同种类的靶细胞，补体的溶解效果亦不相同；例如革兰阴性杆菌、支原体、异体红细胞和血小板对补体很敏感；革兰阳性菌对补体不敏感。
补体的溶细胞反应不仅可以抗菌，也可抵抗其它微生物及寄生虫的感染。病毒在与相应的抗体结合后，补体的参与可显著增强抗体结病毒的灭活作用，其机制可能是直接溶解有包膜的病毒，防止病毒对易感细胞的吸附和穿入，或干扰病毒在细胞内的增殖。补体缺陷的病人，机体易受病原微生物的侵害。另一方面，补体也常常引起病理性反应，例如异型输血时的溶血反应，自身免疫病时的细胞损伤等都可由补体系统引起。
（二）免疫复合物清除作用
补体在活化过程中生成的中间产物，例如C3b和C4b等，对抗原抗体复合物有很强的亲和力，可共价结合到免疫复合物上，然后通过补体的其他效应对免疫复合物产生抑制或清除作用。
1．吞噬调理作用人及哺乳类动物的单核－巨噬细胞和中性粒细胞表面都在C3b和C4b受体，能与带有补体成分的免疫复合物相结合，将两者连接起来，促进吞噬细胞对免疫复合物的吞噬作用。在这种意义上，补体也可称为非特异性调理素（opsonin）。补体成分C3b、C4b、iC3b均有调理作用，这种调理作用在机体的抗感染过程中具有重要意义。
2．免疫粘附作用带有补体成分的免疫复合物还可通过C3b受体结合到红细胞和血小板的表面（免疫粘附作用）。被粘附的免疫复合物在肝中得到处理，或者通过吞噬作用促进其清除。
3．免疫复合物抑制作用C3和C4对免疫复合物的共价结合可导致如下结果：①阻碍免疫复合物相互结合形成大的网格而易于在组织中沉积；②阻止免疫复合物激活补体而诱发一系列的病理损伤；③可破坏免疫复合物的空间结构而使其溶解。上述作用对免疫复合物病有抑制效果，在补体活性降低或补体缺乏时，易发生免疫复合物病或使病情加重。
（三）炎症介质作用
补体是机体重要的炎症介质之一，可通过许多途径引起不同的炎症。
1．过敏毒素作用C5a和C3a可以作用到肥大细胞和嗜碱性粒细胞的细胞膜上，使细胞脱颗粒，释放组胺、白三烯及前列腺素等活性介质，引起类似过敏反应的病理变化（见第八章），所以将C5a和C3a称为过敏毒素（anaphylatoxin）；现已发现C4a亦有较弱的过敏毒素作用。这类作用可被抗组胺药物封闭。
2．趋化作用C4a、C5a、C3a和C5b67是中性粒细胞和单核－巨噬细胞的趋化因子（chemotaxin），可使这些吞噬细胞向炎症部位聚集，加强对病原体的吞噬和消除，同时引起炎症反应。
3．激肽样作用C2a、C4a等具有激肽样活性，能增强血管的通透性，引起炎性充血。
